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Le BIAM
Faire progresser le champ des connaissances
L’objectif de notre institut est de faire progresser de nombreux champs de la connaissance et de développer des concepts biotechnologiques. Pour y parvenir, 8 équipes scientifiques étudient les mécanismes de réponse et d’adaptation de ses modèles biologiques de prédilection que sont les bactéries, les microalgues, les algues et les plantes, face aux contraintes de leur environnement.
Équipes et thèmes de recherche
Pour résister aux situations environnementales défavorables, les plantes ont développé des stratégies de tolérance fondées sur la mise en place de nombreux mécanismes biochimiques et moléculaires. L’équipe PPV s’est intéressée durant de nombreuses années à certains acteurs protéiques qui contribuent à l’adaptation des plantes face aux fluctuations de leur environnement physique et biologique.
Soutenances de thèses de l’institut
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2024
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
BIAM/EBM | M | DAO | Ousmane | CEA | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Biologie synthétique pour la production de lipides chez les micro- algues | 22/03/2024 |
BIAM/MEM | Mme | MANGIN | Camille | CEA | AMU | ED062 | C LEFEVRE | Biominéralisation intracellulaire par les microorganismes des interfaces oxiques-anoxiques : diversité, mécanismes et évolution | 25/01/2024 |
BIAM/MEM | M | MARMOL | Malo | CEA | AMU | ED250 | D FAIVRE | Exploiter le transport et la rhéologie, assistés par un champ, d’un magnétofluide bactérien | 09/07/2024 |
BIAM/IPM | M | PAMART | Edern | CEA Saclay | V CHAPON | 22/02/2024 |
2023
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet de thèse | Date de soutenance |
BIAM/SAVE (BEAM) | Mme | BRAAT | Jeanne | CEA | AMU | ED062 | M HAVAUX | Une nouvelle voie de signalisation cellulaire connectant photosynthèse et tolérance des plantes aux stress climatiques | 13/12/2023 |
BIAM/P&E | M | HACHEMANE | Mohand | CEA | AMU | ED062 | J ALRIC | Optimisation de la fixation du CO2 par une approche combinée de modélisation, combinant ressources génétiques et biophysique | 14/12/2023 |
BIAM/IPM | M | MOHAMAD ALI | Abbas | CEA | AMU | ED062 | V CHAPON | Mécanismes moléculaires de la tolérance à l’uranium chez Microbactérium. | 30/06/2023 |
BIAM/LGBP | M | PERDOUX | Romain | CEA | AMU | ED062 | B MENAND | Régulation de la prolifération et de la production de lipides par les kinases TOR et DYRK chez les plantes et les algues. | 24/11/2023 |
BIAM/P&E | Melle | SAINT-SORNY | Maureen | CEA/DRT | AMU | ED062 | F DELRUE X JOHNSON | Improving CO2 fixation by microalgae through a combined genetic, metabolic and process engineering approach | 12/06/2023 |
BIAM/EBM | M | SAMIRE | Poutoum | CEA | AMU | ED062 | F BEISSON | Optimisation de l’acide gras photodécarboxylase pour une production microbienne d’hydrocarbures | 30/05/2023 |
BIAM/LEMIRE | M | TULUMELLO | Joris | BIOINTRANT | AMU | ED062 | T HEULIN | Recherche in silico de clusters de gènes bactériens impliqués dans la production d’exopolysaccharides | 22/05/2023 |
2022
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
BIAM/SAVE | Melle | HANI | Sahar | CEA | AMU | ED062 | L NUSSAUME | Développement d’une sonde ionique du phosphate chez les plantes grâce à l’imagerie in vivo de la transcription. | 27/06/2022 |
BIAM/SAVE | Melle | LE PODER | Léa | CEA | AMU | ED062 | T DESNOS | Exsudation racinaire d’acides organiques et phytoextraction de métaux | 16/11/2022 |
BIAM/LEMIRE | M | MACIAS PEREZ | Luis | AMU CEREGE puis CEA prolongation | AMU | ED251 | W ACHOUAK | Critical Raw Element Bioextraction (CELEBEX) | 22/06/2022 |
BIAM/SAVE | Melle | MERCIER | Caroline | Groupe ROULLIER puis CEA prolongation | AMU | ED062 | T DESNOS | Etude du mécanisme d’action d’un phytostimulant biosourcé sur la voie de signalisation multi-stress STOP1-ALMT1. | 27/09/2022 |
BIAM/MEM | Melle | PARK | Yeseul | CEA | AMU | ED250 | D FAIVRE | Biominéralisation bactérienne de greigite : du mécanisme de formation aux applications | 01/07/2022 |
2021
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
BIAM/EBM | Melle | LAFFONT | Clémentine | AMU MINISTERE | AMU | ED062 | P ARNOUX | Spécificité de substrat dans les voies de biosynthèses des métallophores bactériens dérivés de la nicotianamine. | 22/03/2021 |
BIAM/MEM | M | MAGERAND | Romaric | CEA | AMU | ED062 | N DE GROOT | Caractérisation d’un nouveau mécanisme de réponse aux radiations chez les bactéries radio-résistantes du genre Deinococcus | 24/03/2021 |
BIAM/MEM | M | MATHON | François | CEA | PARIS DIDEROT | ED560 | C LEFEVRE | Signature des magnétites produites par les bactéries magnétotactiques : perspectives chimiques et isotopiques | 09/12/2021 |
2020
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
M | MATHIOT | Charlie | CEA/DRT | J ALRIC F DELRUE | Measurement of photosynthetic linear and cyclic electron flows, CO2 capture in green microalgae | 17/12/2020 | |||
BIAM/L3BM | M | TORRES-ROMERO | Ismael | CEA | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Vers un contrôle génétique de l’accumulation de lipides chez la microalgue modèle Chlamydomonas reinhardtii | 27/01/2020 |
2019
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
BIAM/L3BM | M | BURLACOT | Adrien | CEA | AMU | ED062 | G PELTIER | Photoproduction d’hydrogène chez les microalgues : rôle protecteur des flavodiirons | 03/12/2019 |
BIAM/L3BM | Mme | CHAZAUX | Marie | AMU MINISTERE | AMU | ED062 | G PELTIER | Etude des déterminants de la spécificité des phosphatases des thylakoïdes | 05/07/2019 |
BIAM/SBVME/L3BM | M | LIANG | Yuanxue | AMIDEX | AMU | ED062 | Y LI BEISSON | Molecular mechanisms leading to higher oil accumulation in green microalgae. This project thus will be instrumental for future biofuel applications. | 17/01/2019 |
BIAM/SBVME/LBC | M | MAZIANI | Pierre-Xavier | CEA/PACA | AMU | ED062 | P ARNOUX | Valorisation du CO2 par les Formiate déshydrogénases microbiennes | 28/06/2019 |
BIAM/L3BM | Mme | MOULIN | Solène | AMU Bourse ENS | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Caractérisation d’une photoenzyme catalysant la synthèse d’hydrocarbures chez les microalgues | 18/12/2019 |
BIAM/LBC | Mme | PREVERAL | Sandra | CEA | Aix marseille Université | ED062 | D PIGNOL | Ingénierie et utilisation des magnétosomes pour des applications médicales | 04/07/2019 |
BIAM/LIPM – LGBP | Mme | ZUCCARELLO | Lidia | CEA | AMU | ED062 | R HIENERWADEL | Oxydation de l’eau dans le photosystème II étudiée dans le domaine infrarouge lointain | 15/04/2019 |
2018
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
BIAM/SBVME /LGBP- LUMINY | M | BARRADA | Adam | AMU | AMU | ED062 | B MENAND | Découverte de nouveaux composants de la voie de TOR de plante par une approche génétique | 08/06/2018 |
BIAM/SBVME/LEMP | Mme | BEAUGELIN | Inès | CEA | AMU | ED062 | M HAVAUX | Biocarburants végétaux: décryptage des voies de signalisation énergétique régulant les défenses cellulaires et le stockage de l’énergie chez les organismes photosynthétiques en réponse aux conditions environnementales | 17/12/2018 |
BIAM/SBVME /LBC | Mme | DESCAMPS | Elodie | CEA | AMU | ED062 | D PIGNOL | Greigite ou Magnétite: les déterminants environnementaux et génétiques contrôlant la biominéralisation chez les bactéries magnétotactiques | 12/02/2018 |
BIAM/SBVME /LGBP- LUMINY | Mme | DIMNET | Laura | CEA/PACA | AMU | ED062 | C ROBAGLIA | Mécanismes d’adaptation de la croissance des plantes aux conditions environnementales de stress oxydant par la Topoisomérase VI (ADASOX) | 16/11/2018 |
BIAM/SBVME/L3BM | M | DUMAS | Louis | CEA | AMU | ED062 | G PELTIER | Optimisation de la conversion photosynthétique d’énergie pour une productivité de biomasse 3G accrue | 24/01/2018 |
BIAM/SBVME/LIPM | M | GALLOIS | Nicolas | CEA | AMU | ED062 | V CHAPON | Réponse cellulaire d’isolats environnementaux de Microbacterium à une exposition à l’uranium | 15/11/2018 |
BIAM/SBVME /LGBP- LUMINY | M | HARCHOUNI | Seddik | CEA | AMU | ED062 | B MENAND | Manipulation des voies de signalisation afin d’améliorer la transformation de l’énergie lumineuse en biocarburant | 19/12/2018 |
BIAM/TIRO – NICE | Mme | HURAULT | Lucile | CEA | Univ NICE SOPHIA ANTIPOLIS | ED085 | G CARLE | Nouvelles approches ex vivo pour l’étude de la toxicité et de la décorporation osseuse de l’uranium aux faibles doses | 30/11/2018 |
BIAM/TIRO – NICE | Mme | JING | Lun | CEA | Univ NICE SOPHIA ANTIPOLIS | ED085 | T POURCHER | Mécanismes moléculaires de la régulation de la fonction thyroïdienne par l’iode | 28/06/2018 |
BIAM/SBVME/LEMIRE | Mme | JIVKOVA | Desislava | ARD | AMU | ED062 | W ACHOUAK T HEULIN | Caractérisation de l’exopolymère de la bactérie Ramlibacter tataouinensis et ses applications industrielles | 02/07/2018 |
SBVME/LEMIRE | M | ORTET | Philippe | CEA | AMU | T HEULIN | Nouveaux outils bioinformatiques pour l’annotation des génomes | 25/09/2018 | |
BIAM/SBVME/LEMP | M | RONDET | Damien | NIXE | AMU | ED062 | JL MONTILLET | Caractérisation moléculaire et fonctionnelle d’une nouvelle voie de signalisation conduisant à la fermeture stomatique en réponse aux stress environnementaux. Intérêts pour la production de biocarburants | 29/03/2018 |
2017
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME /LBC | M | ABBE | Jean Baptiste | CEA | AMU | ED062 | M SABATY | Modification génétique des bactéries magnétotactiques pour la bioremédiation du cobalt | 07/03/2017 |
BIAM/SBVME/LEMIRE | M | CHABERT | Nicolas | CEA | AMU | ED062 | W ACHOUAK | Piles à combustible microbiennes : potentiel des bactéries à générer de l’électricité | 21/12/2017 |
BIAM/SBVME/L3BM | M | CHAUX | Frédéric | CEA | AMU | ED062 | G PELTIER | Développement d’une méthode de criblage de microalgues à fort rendement quantique pour la production de biocarburants 3G | 27/04/2017 |
BIAM/SBVME /LGBP- LUMINY | Mme | CREPIN | Aurélie | AMU MINISTERE | AMU | ED062 | S CAFFARRI | Regulation of light harvesting in plants: role of LHCII isoforms and their phosphorylation in photosystem I and II supercomplexes | 01/12/2017 |
SBVME/LBDP | Mme | GENIES | Laure | IRSN | AMU | ED062 | A VAVASSEUR | Etude des transporteurs impliqués dans l’absorption racinaire et la translocation aux parties aériennes du césium chez Arabidopsis thaliana et Oryza sativ | 26/01/2017 |
BIAM/SBVME/LBDP | M | HANCHI | Mohamed | CEA | AMU | ED062 | H JAVOT | Dynamique intracellulaire du transport ionique chez les plantes par des approches d’imagerie en temps réel | 28/11/2017 |
SBVME/LEMIRE | M | LAVEILHE | Arnaud | IN VIVO | AMU | ED062 | W ACHOUAK T HEULIN | Potentiel d’un inoculum mixte dans l’amélioration de la santé du colza. | 20/10/2017 |
BIAM/SBVME/LEMP | Mme | LOUSSOUARN-YVON | Margot | NATUREX | AMU | ED062 | M HAVAUX | Aspects biochimiques, métaboliques et fonctionnels des antioxydants diterpénoïdes du romarin et leurs applications | 07/11/2017 |
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME/LEMP | Mme | CERVEAU | Delphine | CEA/PACA | AMU | ED062 | P REY | Rôles des mécanismes d’oxydation des protéines dans la tolérance des plantes aux contraintes environnementales | 25/02/2016 |
SBVME/L3BM | M | SORIGUE | Damien | CEA/PACA | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Etude et optimisation de la production d’hydrocarbures par les microalgues | 06/12/2016 |
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME/LEMIRE | Mme | AVELLAN | Astrid | AMU CEREGE | AMU | ED251 | A MASION, C LEVARD, W ACHOUAK | Ecotoxicité d’imogolites et protoimogolites sur les bactéries et dans la rhizosphère. Comparaison avec des nanotubes de carbone | 09/12/2015 |
SBVME/LBDP | Mme | AYADI | Amal | UNIV SFAX | AMU | ED062 | L NUSSAUME | Caractérisation de transporteurs de phosphate chez des mutants d’Arabidopsis thaliana :étude de l’effet sur la tolérance aux métaux lourds | 24/04/2015 |
SBVME/L3BM | Mme | CAGNON | Caroline | CEA | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Vers un contrôle génétique de l’accumulation de lipides chez les microalgues | 02/04/2015 |
SBVME/L3BM | Mme | DANG | Van | CEA | AMU | ED062 | G PELTIER | Régulation de transfert photosynthétique d’électrons et photo-production d’hydrogène chez les microalgues | 28/01/2015 |
SBVME/L3BM | M | GOOLD | Hugh | UNIV SIDNEY – Cotutelle Franco Australienne | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | “Lipid metabolism and storage in the microalga Chlamydomonas reinhardtii” | 15/03/2015 |
SBVME/LEMIRE | M | HAMIDAT | Mohamed | AMU LABEX SERENADE puis CEA | AMU | ED062 | C SANTAELLA | Relation entre l’éco-conception de nanomatériaux intégrés dans les traitements de surface et leur biotransformation dans un écosystème terrestre. | 08/12/2015 |
SBVME/LBDP | Mme | RENAUD | Jeanne | CEA/PACA | AMU | ED062 | N LEONHARDT | Etude du rôle des H+-ATPase de la membrane plasmique dans la régulation des mouvements stomatiques | 27/10/2015 |
SBVME/LEMP | M | SHUMBE | Leonard | CEA | AMU | ED062 | M HAVAUX | Signalisation de l’oxygène singulet et acclimatation de la photosynthèse aux contraintes de l’environnement | 15/12/2015 |
Equipe de recherche | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME /LEMP | Mme | BOCA | Simona | CEA ACTION MARIE CURIE | AMU | ED062 | M HAVAUX | Tolérance de la plante modèle Arabidopsis thaliana au stress photo-oxydant: mécanismes de protection des membranes chloroplastiques contre la peroxydation lipidique | 10/03/2014 |
SBVME/LBC | M | GHSSEIN | Ghassan | CEA/PACA | AMU | ED062 | D PIGNOL | Nicotianamine et phytochélatine synthases: approches structure-fonction | 13/03/2014 |
SBVME/LEMIRE | Mme | HARFOUCHE | Lamia | CEA | AMU | ED062 | W ACHOUAK | Identification et caractérisation de nouveaux ARNs non codant régulateurs chez Pseudomonas brassicacearum | 26/09/2014 |
SBVME/LBC | Mme | LUDANYI | Monika | CEA | AMU | ED062 | N DE GROOT | Mécanismes de l’extrême radio-tolérance de Deinococcus deserti : caractérisation du régulon de réponse aux radiations | 27/11/2014 |
SBVME/LBC | Mme | MANNOUBI | Soumaya | CEA | AMU | ED062 | D PIGNOL | Fonctionnalisation du magnétosome bactérien | 26/02/2014 |
SBVME/L3BM | M | VERDIER | Gaëtan | CEA | AMU | ED062 | G PELTIER | Production de lipides extracellulaires chez les plantes et les microalgues. | 18/12/2014 |
Affectation | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME /LBC | Mme | BARRET | Laurie Anne | UNIV AVIGNON/PACA | UNIV AVIGNON | A POLIDORI F BONNETE C JUNGAS | Caractérisation et valorisation de complexes membranaires photosynthétiques producteurs d’énergie par de nouveaux outils moléculaires | 28/06/2013 | |
SBVME/L3BM | Mme | CANO | Mélissa | CEA/PACA | AMU | ED062 | P RICHAUD | Bioproduction d’hydrogène chez la cyanobactérie Synechocystis PCC6803. | 24/09/2013 |
SBVME /LEMP | Mme | COURTEILLE | Agathe | CNRS | AMU | ED062 | D RUMEAU | Caractérisation des mécanismes de régulation redox de la biosynthèse des caroténoïdes au cours du murissement de la tomate. | 25/01/2013 |
SBVME/LEMS | M | CUN | Pierre | CEA/PACA | AMU | A VAVASSEUR | P1B-ATPAses et accumulation de métaux lourds in planta. | 19/06/2013 | |
SBVME/LGBP | Mme | FLORIS | Maïna | AMU MINISTERE | AMU | ED062 | C ROBAGLIA | Etude des régulations post-transcriptionnelles en réponse à la forte lumière chez Arabidopsis thaliana. | 22/02/2013 |
SBVME/LGBP | Mme | KHUONG | Thi thu huong | Gouv Vietnamien | AMU | ED062 | C ROBAGLIA | Manipulation de la capture de la lumière pour augmenter la productivité des plantes et économiser l’énergie. | 17/01/2013 |
SBVME/LGBP | Mme | LECAMPION | Cécile | AMU | AMU | ED062 | C ROBAGLIA | Import de l’ARNm de eIF4E dans le chloroplaste. | 13/12/2013 |
SBVME/L3BM | Mme | NGUYEN | Thi Hoa Mai | CEA | AMU | ED062 | Y LI-BEISSON | Régulation du stockage d’énergie et production de biocarburant chez les microalgues. | 07/03/2013 |
SBVME /LIPM | M | THEODORAKOPOULOS | Nicolas | IRSN | C BERTHOMIEU C SERGEANT | Etude des communautés bactériennes de la tranchée T22 sur le site d’exclusion de Tchernobyl (GNR TRASSE). | 20/12/2013 |
Affectation | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME/LBDP | Mme | ARNAUD | Carole | MINISTERE | AMU | ED062 | L NUSSAUME | Etude de la voie de signalisation à la carence en phosphate chez Arabidopsis thaliana par une approche de chémogénomique | 25/06/2012 |
SBVME/LGBP | Mme | CAST | Delphine | AXA | AMU | C ROBAGLIA | Evolution des mécanismes d’adaptation des plantes aux changements climatiques | 14/12/2012 | |
SBVME/LEMIRE | M | LALAOUNA | David | CEA | AMU | ED062 | W ACHOUAK | Rôle des ARN non codant régulateurs dans l’adaptation des bactéries aux fluctuations de l’environnement | 09/03/2012 |
SBVME/LIPM | M | PARDOUX | Romain | CEA | AMU | ED062 | C BERTHOMIEU | Optimisation de sites protéiques de fixation de l’uranium. | 12/12/2012 |
Affectation | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME/LEMS | M | AUBERT | Yann | MINISTERE | UNIV P. Sabatier TOULOUSE | ED151 | A VAVA SSEUR JP GALAUD | Analyse fonctionnelle de deux protéines de liaison au calcium et étude de leur implication dans les réponses au stress hydrique et à l’acide abscissique | 16/06/2011 |
SBVME/LBDP | Mme | BONNOT | Clémence | CEA | AMU | ED062 | T DESNOS | Étude de la fonction de LPR1, une oxydase à cuivre régulant la croissance racinaire d’Arabidopsis en condition de stress métallique | 14/11/2011 |
SBVME/LGBP | M | DEVERT | Anthony | AMU MINISTERE | AMU | C ROBAGLIA | Etude des ARN polymérase ARN dépendantes impliquées dans le mécanisme RNA silencing chez les plantes | 21/10/2011 | |
SBVME/LEMS | Mme | KRONIEWICZ | Laetitia | AMU MINISTERE | AMU | A VAVASSEUR | Etude du rôle d’un canal chlorure impliqué dans la régulation des courants anioniques de type S de la cellule de garde chez At | 25/01/2011 | |
SBVME/LGBP | M | MAHGOUB | Hany | Gouv Egyptien | AMU | C ROBAGLIA | Régulation posttranscriptionnelle de l’expression génétique chez Arabidopsis thaliana | 06/05/2011 | |
SBVME /LBC | M | RIOUX | Jean Baptiste | CEA | AMU | D PIGNOL | Bioingénierie moléculaire du magnétosome bactérien pour des applications biotechnologiques | 16/03/2011 |
Affectation | Titre | Nom | Prénom | Organisme employeur | Université d’inscription en doctorat | Ecole doctorale | Directeur de thèse | Sujet | Date soutenance |
SBVME /LEMP | Mme | JANNAUD DROUET | Dorothée | CNRS | AMU | B GENTY | Etude des transferts d’H2O et de CO2 et du rôle des aquaporines dans le mésophylle par une nouvelle approche non invasive | 27/10/2010 | |
SBVME/LIPM | Mme | MONDANI | Laure | AMU MINISTERE | AMU | C BERTHOMIEU | Exploitation d’ADN environnemental pour l’identification de mécanismes de résistance à l’uranium | 23/11/2010 |