Équipe BEAMM

Biodiversité, Écologie et Adaptation
des Microorganismes Magnétotactiques

Images de microscopie électronique en transmission de bactéries magnétotactiques environnementales. Les barres d'échelle correspondent à 0,5 µm.

Objectif de l’équipe

Notre équipe s’intéresse à la biodiversité, l’écologie et l’adaptation des microorganismes aux contraintes environnementales dans les milieux aquatiques à forte pression physicochimique.

Nous menons une mission d’exploration de la diversité pour :

  • Révéler de nouvelles innovations biologiques et stratégies écologiques impliquées dans le fonctionnement et l’évolution du vivant
  • Proposer des modèles microbiens à forte valeur ajoutée dans le domaine des biotechnologies

Nous nous intéressons également aux mécanismes sous-jacents afin de :

  • Déterminer les bases génétiques, moléculaires et physiologiques impliquées dans la détection et la séquestration des éléments chimiques physiologiquement importants ou toxiques,
  • Élucider les bases fonctionnelles et évolutives des organites procaryotes très spécialisés, et
  • Comprendre les réponses des microorganismes aux fluctuations environnementales et leurs impacts dans les cycles biogéochimiques à l’échelle du cycle de vie de l’organisme jusqu’à l’échelle des temps géologiques.

Interdisciplinarité

Ces missions sont assurées par plusieurs projets individuels s’inscrivant dans une approche scientifique circulaire et intégrative au niveau de l’équipe, dans laquelle nous appréhendons les questions et les systèmes à différentes échelles de temps et de complexité biologique ; i.e. de l’échelle nanométrique aux écosystèmes, et du moléculaire aux communautés. Notre fonctionnement repose sur un réseau d’interactions entre des approches globales exploitant les données de haut débit de dernière génération et des approches mécanistiques et pluridisciplinaires impliquant des échantillonnages en milieu aquatiques, la culture, la physiologie microbienne, la biochimie, la biologie moléculaire et différentes approches de microscopie, de spectroscopie et de phylogénie moléculaire.

Projets collaboratifs

Les membres de l’équipe BEAMM sont porteurs ou partenaires de plusieurs projets financés dans lesquels s’insèrent leurs trois grands thèmes de recherche

Nos principaux projet en cours :

  • ANR-21-CE01-0010 – Contribution des bactéries magnétotactiques à la séquestration du carbone inorganique et des éléments alcalino-terreux par la formation de phases minérales carbonatées intracellulaires – CarboMagnet (Coordination Caroline Monteil)
  • ANR-21-CE02-0034 – Etude de la biodiversité, de l’écologie et de l’évolution de la symbiose magnétotactique – SymbioMAGNET (Coordination Christopher Lefevre)
  • 2023-2024 IM2B – Décryptage du réseau de régulation impliquant le régulateur central du chimiotactisme et des acteurs de la synthèse et de la détection du di-GMPc par une combinaison d’approches in silico, in vitro et in vivo (Coordination Philippe Ortet)
  • ANR-23-CE02-0006 – Etude de l’écologie et du fonctionnement de la relation symbiotique entre des nanobactéries (CPR) et des bactéries magnétotactiques – MTB-CPR (Coordination Christopher Lefevre)

Responsable d'équipe

Christopher LEFEVRE

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Mots clés

Génomique, biologie moléculaire, microbiologie, biochimie, microscopie, écologie, biodiversité, évolution, biominéralisation, magnétoréception, interactions symbiotiques.