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Équipe EBMP

"Environnement, Bioénergies, Mi(a)croalgues et Plantes"

Recherches fondamentales à visées applicatives dans les domaines de la perception/l’homéostasie des nutriments, du métabolisme des lipides et de la fixation du carbone atmosphérique chez les organismes photosynthétiques (plantes, mi(a)croalgues, cyanobactéries).

Les organismes photosynthétiques (plantes, algues et cyanobactéries) ont le potentiel de répondre à trois enjeux sociétaux majeurs : la sécurité alimentaire, la sécurité énergétique et le changement climatique. Pour domestiquer ces organismes afin de répondre à ces grands enjeux, une meilleure compréhension des mécanismes fondamentaux de la  photosynthèse, du métabolisme carboné, de la perception des nutriments et de l’allocation du carbone et de leur intégration est souhaitable.

L’objectif de notre équipe est de mieux comprendre les mécanismes moléculaires inhérents à ces processus biologiques, et d’en identifier les étapes limitantes, ces connaissances fondamentales étant nécessaires à l’amélioration des organismes photosynthétiques. Au niveau fondamental, nous nous intéressons aux mécanismes de détection et de capture des nutriments, à l’énergétique cellulaire et à la régulation des flux de carbone vers les composés riches en énergie (lipides, hydrocarbures, polysaccharides). En particulier nous cherchons à identifier les acteurs moléculaires clés impliqués dans la signalisation, le métabolisme et l’énergétique cellulaire afin d’étudier leur impact sur la physiologie et la productivité des organismes considérés. Au niveau biotechnologique, nous utilisons ces connaissances pour proposer des stratégies innovantes afin d’augmenter la productivité en biomasse, réduire les intrants, améliorer la productivité en lipides ou polysaccharides, ou de produire des hydrocarbures biosourcés.

Orientations scientifiques : de la perception des nutriments à la capture du CO2, au stockage du carbone et à la synthèse des alcanes
 
Nos modèles de recherche sont principalement Chlamydomonas reinhardtii et Arabidopsis thaliana



Compétences thématiques et techniques:

– Thématiques:
  • Métabolism des lipides (algues et plantes);
  • Photosynthèse et capture du CO2
  • Développement racinaire et molécule signal (inositol pyrophosphate)
  • Nutritions minérales (phosphate, fer, azote, aluminium…)
  • Génétique et physiologie des microalgues et des plantes
  • Chimie verte
– Techniques:
  • Fluorescence de la chlorophylle;
  • Analyse des gaz par spectrométrie de masse à introduction membranaire (MIMS);
  • Lipidomique;
  • Cultures de microalgues en photobioréacteurs instrumentés;
  • Genome editing (Crispr-cas9…);
  • Biochimie des protéines; Biologie moléculaire;
  • Imagerie en temps réelle (Spinning disk);
  • Microfluidique;
  • Double hybride en levure;
  • Cytométrie en flux; FISH 

Les exemples de les dernieres publications d'EBMP

Our discovery of the FAP
Our discovery of the FAP! - Sorigue et al 2017
More on understanding the mechanism and dynamics of FAP - Sorigue et al 2021
Alternative photosynthesis pathways drive the algal CO2-concentrating mechanism - Burlacot et al 2022

Plus d'informations

 

Video 1 : 

The City of energies: focus on microalgae 

(crédit: la cellule de communication CEA Cadarache)

Video 2 :

Mettez une algue dans votre moteur – Grâce à l’enzyme FAP, the Fatty Acid Photodecarboxylase! 

(crédit: S. Moulin, C. Sahut, D. Sorigue, F. Beisson)

Video 3 :

Observation d’une protéine associée à des gouttelettes de lipides dans une cellule de microalgue

(crédit: Marie Bertrand)